Rémy est un jeune rat qui rêve de devenir un grand cuisinier. Ni l'opposition de sa famille, ni le fait d'être un rongeur dans une profession qui les déteste ne le font reculer. Rémy est prêt à tout pour vivre sa passion de la cuisine...et le fait de se retrouver dans les égouts du restaurant parisien ultra réputé créé par Auguste Gusteau va lui donner l'occasion ! Malgré le danger et les pièges que réservent cet univers interdit, Rémy va former une bien curieuse équipe avec Linguini, le garçon chargé des poubelles, qui découvre par hasard ses fabuleux talents. En concluant un pacte, le rat et le garçon vont déclencher une série d'événements extraordinaires qui vont révolutionner le monde prestigieux de la haute gastronomie française... Ecartelé entre ses aspirations et sa condition, Rémy va découvrir le vrai sens de l'amitié, de la famille...et comprendre qu'il doit trouver le courage d'aller au bout de son rêve et d'être lui-même : un rat qui veut être cuisinier...